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オートバイは、日本では他にバイクや単車などとも呼ばれる。「単車」は、側車とも呼ばれるサイドカーと区別するために用いられた言葉だが、サイドカーが希少なものとなった後も単車という言葉は生き残っている。
オートバイという呼称は1920年代には既に用いられていた(2006年現在も出版されている月刊誌「オートバイ」は1923年創刊である)。この言葉は米語 autobike から作られた和製英語であり、英語圏では通用しない。英語圏では、motorcycle, motorbike, autobicycle と呼ばれるほか、moto や cycle という略称も使われる。英語では、一般に「バイク(bike)」というと自転車(bicycle)を意味するので、注意が必要である。
排気量が小さいオートバイのことを、警察関係や報道関係では「ミニバイク」と呼ぶことがある。